Наука довгий час вважала головною складовою частиною живої клітини її оболонку. До цього висновку прийшли Н. Грюі і М. Мальпігі в 1671 році в процесі вивчення анатомії рослин, коли виявили найдрібніші осередки.

У 1674 році А. Левенгук вивчав під мікроскопом клітини тваринних організмів. Але рівень знань в ту пору не дозволяв однозначно стверджувати, що розгадана фізіологія клітини. Як і раніше вважалося, що найважливіша частина клітини - її оболонка.

І тільки через двісті років у міру вдосконалення мікроскопа і самої техніки вивчення таких малих об`єктів вдалося накопичити достатній обсяг знань, щоб знову впритул зайнятися вивченням живих клітин. Прийшов час почати розглядати не просто окрему клітку поза цілісної системи, а повнішу організацію органічного життя.
Саме на цьому тлі англійський ботанік Роберт Браун в 1883 році зміг заявити про новий, раніше невідомому компоненті живої клітини: про її ядрі.

Приблизно в той же час німецький ботанік М. Шлейден прийшов до важливого висновку про цілісну клітинної організації рослин. У 1838 році зоолог Т. Шванн досліджує зоологічні об`єкти, а також, зіставляючи дані попередників, приходить до найважливішого досягнення теоретичної біології: клітина є елементарна одиниця будови і розвитку всіх живих організмів, будь то рослина чи тварина. Ця теорія згодом була багаторазово перевірена на практиці.

Незабаром німецький лікар Р. Вірхов прийшов до висновку, а потім і довів, що поза клітинами життя не існує. Крім цього весь науковий світ потрясло його головне відкриття: у клітин існує найголовніша складова - ядро.

Академік Російської АН Карл Бер відкриває яйцеклітину у ссавців і встановлює, що абсолютно всі організми починають розвиватися з однієї єдиної клітини. Таким чином, відкриття К. Бера довело, що клітина не тільки одиниця будови, але і одиниця розвитку всіх живих організмів.

Подальше вивчення структури клітин, а так само вдосконалення мікроскопів (створення електронного мікроскопа), дали можливість зазирнути ще глибше в таємницю клітини, вивчити її складну структуру і почати вивчення протікають в клітинах процесів.

Сьогодні можна стверджувати, що клітинна теорія повністю підтверджена, що кожна клітина має мембранне будова, і найважливішою її частиною є ядро, а розмножуються клітини поділом. Крім того, можна стверджувати, що клітинне будова - свідчення єдиного походження тварин і рослин.

Саме клітинна теорія лягла в основу цитології, науки про будову, склад і пристрої клітин, а також цитогенетики - науки, яка описує передачу спадкових ознак на клітинному рівні.